Микеркин в органах прокуратуры начал работать в 1992 году в должности следователя прокуратуры Вахитовского района Казани. В 2016-2017 году являлся начальником отдела (№ 5) по надзору за исполнением законодательства о защите интересов государства управления по надзору за исполнением федерального законодательства прокуратуры РТ.