На Алпарову было возбуждено уголовное дело по 2 эпизодам по статье 286 УК РФ (превышение должностных полномочий). Среди них экономический спор вокруг антирадарной компанией iBOX и взыскание исполнительного сбора с ООО «Ясная поляна».
По версии следствия, судебные приставы превысили полномочия, наложив арест на технику с маркировкой iBOX и Ultradata – имущество ответчика по арбитражному делу, руководителя «ЭР-Холдинг» Ямалова. Ее отдали на хранение взыскателю – главе «Интерхолдинг» Хусаинову. После отмены ареста и выемки имущества без участия Хусаинова, которое провели приставы другого, Ново-Савиновского райотдела, часть арестованного имущества обнаружена не была. На допрос по этому делу в качестве свидетеля вызывали Алпарову.
Кроме того, Алпарова является обвиняемой по делу о пожаре в ТЦ "Адмирал". По данным следствия, Алпарова знала о том, что руководство ООО «Заря» не устранило нарушения в «Адмирале». 12 ноября 2013 года исполнительное производство было окончено. Проведенная в 2014 году повторная проверка показала, что больше половины нарушений так и не ликвидировали. В результате прокуратура возобновила исполнительное производство в отношении ООО «Заря».