В новой должности Бондаренко будет отвечать за законопроектную деятельность ведомства.
В январе 2003 года Бондаренко начала работу в структуре на должности начальника отдела правовой защиты. В июне 2004 года Бондаренко возглавила правовой отдел в Федеральном агентстве по энергетике. С 2008 года занимала должность директора юридического департамента Минэнерго РФ.