В октябре 2016 года стало известно, что Халиуллина подозревают в мошенничестве при получении государственных субсидий по программе «Лизинг-грант». В полицию обратились сотрудники министерства экономики РТ. По версии МВД по республике, ущерб составил 7 миллионов рублей, а фигурантами дела стали более 20 человек.
В январе 2017 года в рамках дела была задержана жена экс-главы ассоциации Марина Халиуллина. Спустя три месяца задержали и отправили под арест самого Халиуллина. Собеседники Inkazan в ассоциации заявляли, что это было сделано для того, чтобы экс-глава организации дал показания на высокопоставленных чиновников.
В 2018 году Хайруллину избрали меру пресечения в виде «запрета определенных действий». Летом прошлого года Тимура Аюпова, который был его заместителем, приговорили к условному сроку. В суде свидетели отрицали, что Хайруллин лоббировал интересы подставных фирм при распределении грантов.
В апреле 2017 года тогда еще бизнес-омбудсмен РТ Тимур Нагуманов обсуждал с уполномоченным при президенте России по правам предпринимателей Борисом Титовым дело Хайруллина. Последний взял на контроль ход следствия, Нагуманов же отказался озвучить официальную позицию своего аппарата и в целом не поддержал Халиуллина.