Дьяконова задержали 15 августа 2017 года. Его подозревают в служебном подлоге и мошенничестве в особо крупном размере. По версии следствия, директор центра эластомеров университета Игорь Дубовик по указанию Дьяконова искал фирмы-однодневки для обналичивания денег, затем с ними заключались контракты, переводились деньги, которые обналичивали. По завершению процедуры, Дубовик спрашивал у Дьяконова, что делать, а тот рапортовал переводить деньги в Москву лицу, которое следователь не называет.
Сообщалось, что была перечислена сумма в 23 млн рублей, обналичено 1,3 миллиона. Сам Дьяконов обвинения отрицал. По его словам, его оговорил задержанный 24 июля проректор Александр Кочнев. "То, что говорится в обвинительном заключении - правдой не является, и вообще все обвинение построено на заявлении проректора КХТИ Кочнева. Это не правда", - сказал экс-ректор КХТИ.
Дубовика и Кочнева подозревают в мошенничестве в особо крупном размере (ч.4 ст.159 УК РФ). Кочнев на заседании суда по выбору ему меры пресечения признал свою вину и заявил, что раскаивается.
В октябре 2016 года осужденный за многомиллионные хищения бывший проректор КХТИ Ильдар Абдуллин написал открытое письмо на имя главы РТ, в котором сообщил о неоднократных случаях дачи откатов ПАО "Газпром" и федеральным министерствам. Его опубликовала газета "Бизнес online". Он заявил, что действовал по приказу ректора университета Дьяконова, и рассказал, что якобы по просьбе сотрудников вуза в 2014 году передавал ректору деньги для должностных лиц министерства промышленности и торговли России. Дьяконов, кстати, говорил журналистам, что в 2013 году "Газпром" выделил вузу 17 млн рублей, в 2014-м — 19 миллионов.
В январе 2018 года задержали бывшего первого проректора КНИТУ-КХТИ, директора института дополнительного профессионального образования вуза Василия Иванова. Ему избрана мера пресечения в виде домашнего ареста до 11 марта 2018 года. Его подозревают в служебном подлоге и мошенничестве в особо крупном размере. По мнению следствия, инкриминируемые ему преступления связаны с фиктивным трудоустройством в одно из подведомственных учреждений.